В апреле, мае и июне 2009 года ЕГЭ сдавали 995 295 выпускников школ 2009 года и выпускников прошлых лет (в 2008 году - 1 095 781 чел.), доля выпускников текущего года от общего количества участников ЕГЭ составила 93,9%. Число экзаменов составило 3 258 606 (в 2008 году- 2 411 317).

В июле 2009 года ЕГЭ сдавали 137 585 абитуриентов вузов и ссузов (в 2008 году - 166 151 чел.). Число экзаменов составило 244 941 (в 2008 году - 255 026).

Необходимо отметить, что в 2009 году впервые ЕГЭ проводился по испанскому языку, общее количество участников ЕГЭ по данному предмету составило 198 человек из 8 субъектов Федерации.

Основные участники ЕГЭ в мае, июне и июле согласились с полученными результатами по различным предметам (98,4%), по 1,6% (56 335) результатов были поданы апелляции в региональные конфликтные комиссии, часть апелляций (30,7%, 17 297) были удовлетворены.

Количество выпускников, не прошедших государственную (итоговую) аттестацию составляет не более 2,7 %. 100 баллов по разным предметам в июне и в июле 2009 года были получены 2 336 выпускниками и абитуриентами (в 2008 году – 1080), что составляет 0,2 % от общего количества сдававших ЕГЭ в 2009 году.

При этом в рамках мероприятий по контролю за проведением ЕГЭ и в частности за работой региональных предметных комиссий на федеральном уровне были произведены перепроверки 370 100-балльных работ из которых 74, 6% результатов подтвердились.

Кроме того, в рамках контрольных и мониторинговых мероприятий на федеральном уровне проводились перепроверки экзаменационных работ участников экзамена, получивших высокие баллы в отдельных субъектах Федерации, и также перепроверки экзаменационных работ, за которые были существенно повышены баллы по итогам проведения апелляций по результатам ЕГЭ.

В целях обеспечения своевременной выдачи свидетельств о результатах ЕГЭ в 2009 году их распечатка производится в регионах, а заверяются свидетельства выпускников текущего года непосредственно в школах, свидетельства иных категорий участников – в органах управления образованием региона или муниципалитета.

В 2009 году продолжилась практика обязательной проверки свидетельств о результатах ЕГЭ вузами и ссузами Российской Федерации.

Приемные комиссии вузов и ссузов контролируют достоверность сведений об участии в ЕГЭ и результатах сдачи ЕГЭ через Федеральную базу свидетельств о результатах ЕГЭ (далее - ФБС).

На 22 июля 2009 года в ФБС в 2008 году зарегистрировано 4919 пользователей, из них: вузов - 2426, ссузов - 2302 (в 2008 году 2691 пользователь, из них: вузов - 1525, ссузов - 1148).

Общее количество загруженных в ФБС свидетельств за 2008-2009гг. – 2284996. Из них за 2009 год – 991698.

На 22 июля 2009 года общее количество проверенных свидетельств - 3080130, проверенных уникальных свидетельств – 405113. Использование автоматизированной линии для производства экзаменационных материалов в 2009 году позволило применить технологию проведения ЕГЭ, при которой все участники ЕГЭ выполняли задания с различными уникальными номерами. Связь уникального номера контрольного измерительного материала (далее – КИМ) с бланками ответов индивидуального комплекта участника ЕГЭ осуществлялась посредством нанесенных на бланки штрихкодов, также уникальных. Связки штрихкодов по всем индивидуальным комплектам с экзаменационными материалами хранились в соответствующей базе Федерального центра тестирования. Возможность использования уникальных номеров КИМ, значительно повышает информационную безопасность при подготовке и проведении ЕГЭ.

При этом в ходе мониторинга ресурсов Интернет в период проведения ЕГЭ были обнаружены изображения нескольких вариантов КИМ, сделанные участниками ЕГЭ в нарушение процедуры проведения ЕГЭ во время экзаменов, при этом технологические возможности позволили выявить участников экзамена, а также аудитории, в которых они сдавали ЕГЭ, в результате чего результаты экзамена данных участников ЕГЭ были аннулированы, и также наложены меры административной ответственности на организаторов в аудиториях, допустивших данное нарушение процедуры ЕГЭ.
В период проведения ЕГЭ функционировало 4 федеральных и 84 региональных «горячих линий», а также «горячие линии», организованные общественными организациями. В субъектах Российской Федерации введены системы общественного наблюдения за ходом проведения ЕГЭ, в том числе с участием СМИ.

В целом, в 2009 году ЕГЭ прошел в соответствии с требованиями нормативных правовых актов. В ходе контроля проведения ЕГЭ комиссиями Рособрнадзора, а также комиссиями субъектов Российской Федерации, общественными наблюдателями выявляются отдельные нарушения, по которым принимаются меры предупредительного и профилактического характера, направленные на ликвидацию указанных нарушений.

В настоящее время Рособрнадзором проводятся работы по углубленному содержательному анализу полученных результатов ЕГЭ в различных субъектах Федерации и подготовке к проведению работ по интерпретации полученных результатов ЕГЭ с учетом получаемой от регионов мониторинговой информации о ходе и результатах построения региональных систем оценки и контроля качества образования, а также по выявлению корреляции полученных результатов с показателями успешности обучения в вузах и ссузах участников экзамена, поступающих по результатам ЕГЭ.